Der FCM geht aus der Fusion von Spielvereinigung Moosburg e.V. und FC Real Bonau Moosburg e.V. im Jahre 2008 hervor.
Der Verein hat durch Bündelung gemeinsamer Kräfte, insbesondere der Spieler, Trainer, Betreuer und Funktionäre den Jugend- und Fußballsport in Moosburg positiv entwickelt.