Das Naturschutzgebiet “Vogelfreistätte Mittlere Isarstauseen” zählt zu den wertvollsten Wasservogelschutzgebieten Bayerns und ist Bestandteil des Europäischen Schutzgebietsnetzes NATURA 2000.
Wesentliche Lebensräume des Gebietes sind der Mittlere Isarkanal mit den Stauseen bei Moosburg und Eching sowie der Isar mit den angrenzenden Auwaldbereichen. Aus botanischer Sicht sind besonders die Trockenstanorte an den Dämmen der Stauseen und des Isarkanals von Bedeutung. Große Teile des Schutzgebietes sind vom Menschen geschaffene Lebensräume, die in den 30er Jahren zur Stromgewinnung gebaut wurden.